El Rector es la máxima autoridad en la Institución y es nombrado por la Fundación Arquidiocesana para la Educación:
Desde el plan estratégico establecido:
- Lidera, gestiona, e impulsa el Proyecto Educativo Institucional P.E.I., cumpliendo y orientando las políticas gubernamentales y arquidiocesanas.
- Hace vida los cuatro pilares del Plan estratégicos y del proyecto educativo: Espiritual, Humano, Intelectual y Apostólico
- Promueve e impulsa los procesos de mejoramiento continuo para la Institución
- Establece y direcciona los canales de comunicación entre los diferentes miembros de la comunidad
El rector cuenta con el Comité Operativo; conformado por el Coordinador (Académico, y de Normalización), la Secretaría Académica, la Auxiliar Administrativa, la Gestora del SG-SST, la Asesora Escolar y el coordinador del programa fortalecimiento del inglés (SILECS) y con una secretaria que apoya el desarrollo de la labor de la rectoría.